Les caractéristiques spécifiques de l'appaloosa sont nombreuses et liées à ce que l'on appelle en génétique le complex ap

L'appaloosa est un cheval chez qui l'on trouve beaucoup plus de traits caractéristiques que chez les autres chevaux. Si nous voulons étudier l'appaloosa dans les conditions établies pour les autres chevaux, nous nous trouvons devant un puzzle avec de nombreuses pièces dispersées. Dans le cas de l'appaloosa il ne semble pas y avoir de réponses à toutes les questions nombreuses et variées.
Nous pensons que pour mieux comprendre l'appaloosa, il faut étudier un grand nombre d'appaloosas sur pas moins de trois générations. Cela inclut toute la durée de la vie parce qu'il y a de fortes probabilités pour que des changements se produisent à des étapes différentes de la vie y compris les dernières années.
La première question qui vient à l'esprit est : est-ce que l'appaloosa est une race ? Les races de chevaux ont été développées par des gens comme vous et moi … seulement Mère Nature peut créer un appaloosa. L'homme peut produire un Pur-sang, il ne peut pas produire un appaloosa.
Par conséquent l'appaloosa devrait être techniquement considéré comme une espèce ; une espèce dans laquelle l'homme peut développer un grand nombre de races, chacune étant appaloosa.
Est-ce que l'appaloosa est une couleur ? Pas plus que n'importe quelle autre race de chevaux Toutes ont des couleurs sauf le cheval blanc, le blanc étant absence de couleur. Beaucoup d'appaloosas sont reconnus en tant qu'appaloosas par le dessin de leur robe. L'appaloosa a de nombreux modèles de dessin de robe dans toutes les couleurs équines.
L'appaloosa a beaucoup plus de caractéristiques que les autres chevaux, il semblerait probable qu'il ait été le premier cheval dont sont venus les autres.. Nous disons ceci parce que l'homme ne peut pas développer d'appaloosa alors qu'il peut effacer les caractéristiques appaloosa en créant des chevaux de couleur solide.
S'il était possible de renvoyer toutes les races de chevaux à leur état naturel d'origine, tous perdraient leur identité sauf l'appaloosa (le pinto pourrait garder son identité, mais l'homme peut développer un pinto)
Nous présentons ici un tableau des 25 traits caractéristiques. Traits qui font la différence entre l'appaloosa et les autres chevaux.

Le complexe appaloosa comprend un certain nombre de modèles comprenant : léopard, blanket, few spot, frosted, snowflake, snow cap et varnish.
A la suite d'une recherche sur le gène E (extension du noir) une équipe de chercheurs américains dirigée par le Dr.Rebecca Terry, s'est intéressé au complex appaloosa.

En mai -juin 2003, le Dr.Rebecca Terry et son équipe ont fait sur le génome une recherche du gène LP, gène suspecté d'être la "clé" pour la manifestation des autres caractéristiques appaloosa. Les détails attendent pour être publiés l'approbation d'un jury de pairs.
La recherche a été un succès et ont permis de déterminer le chromosome où se trouve LP et d'en limiter la zone de localisation.
L'isolement de ce gène clé qui active les caractéristiques appaloosa (sabots rayés, peau marbrée, sclérotique blanche et roaning appaloosa)et "met en route" le modèle blanc aurait des avantages considérables pour les éleveurs et les registres appaloosa. Le développement d'un test de laboratoire permettant de savoir si le gène LP est présent sur des chevaux qui, à cause d'autres gènes masquant en particulier le gène E (extension du noir) ne montrent pas les caractéristiques appaloosa classiques exigées, rendra possible pour ces chevaux une inscription régulière.
Ce test permettra aussi l'identification exacte des chevaux LP homozygotes, y compris ceux qui ayant un pattern blanc très réduit sont difficiles a identifier par le phénotype seul.
Une autre conclusion excitante résultant de cette étude sur les effets du gène E semble être la découverte d'un gène responsable du pattern blanc appaloosa.. Cela signifie que contrairement aux autres modèles de couleur, le pattern blanc des appaloosas demande 2 gènes essentiels pour apparaître: LP comme clé, et le gène du pattern blanc qui détermine le type et la densité du dessin blanc.
Bien que certains puissent trouver surprenant que deux gènes travaillent ensemble pour produire un dessin blanc dense chez les appaloosas, il n'est pas inhabituel que deux gènes travaillent ensemble à distance. C'est un arrangement commun à beaucoup d'organismes, et il y a beaucoup plus de traits causés par des gènes multiples que par un seul.
Les recherches actuelles sur "deux gènes principaux sur des chromosomes différents" responsables de la robe appaloosa seront une grande avancée pour la compréhension de la transmission du phénotype.